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革兰氏染色原理是通过结晶紫初染和碘液媒染后,在细胞壁内形成了不溶于水的结晶紫与碘的复合物,革兰氏阳性菌遇乙醇或丙酮脱色处理时,不会出现缝隙,因此能把结晶紫与碘复合物牢牢留在壁内,使其仍呈紫色;而革兰氏阴性菌在遇脱色剂后,呈无色,再经沙黄等红色染料复染,就使革兰氏阴性菌呈红色。其中,染色的差异主要是阴性与阳性细菌细胞壁的差异所引起的。
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